Etwas verschnupft Laufen zu gehen ist gesundheitlich nicht bedenklich und normalerweise auch nicht leistungshemmend.
Doch, ob du es glaubst oder nicht, reduziert das Verwenden von Taschentüchern beim Laufen tatsächlich deine Laufleistung. Es gibt ja mittlerweile schon zig Studien zum Thema Laufen, viele davon sind äußerst ungewöhnlich, darunter auch eine Studie aus Großbritannien zur Verwendung von Taschentüchern beim Laufen.